Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Smg9Q9DB90 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms