Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Cpne9Q1RLL3 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms