Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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