Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
EgfrQ01279 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
EgfrQ01279 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms