Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Sh3bp1P55194 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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