Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxd9P28357 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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