Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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