Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Cldn34c2J3QNM1 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms