Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ccdc9bA3KGF9 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Ccdc9bA3KGF9 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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