Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Hdac5Q9Z2V6 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Hdac5Q9Z2V6 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms