Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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