Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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