Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 mt-Tv-201ENSMUST00000082389 69 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim35Q8C006 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim35Q8C006 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim35Q8C006 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim35Q8C006 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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