Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clcn1Q64347 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms