Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
Ccdc18Q640L5 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
Ccdc18Q640L5 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms