Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ptchd1Q14B62 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ptchd1Q14B62 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms