Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms