Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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Sh3bp1P55194 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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