Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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