Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
DffaO54786 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
DffaO54786 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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