Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Limd1Q9QXD8 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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