Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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