Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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