Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms