Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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Sh3bp2Q06649 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp2Q06649 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sh3bp2Q06649 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms