Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PtpreP49446 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PtpreP49446 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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