Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Rpl28P41105 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rpl28P41105 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms