Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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