Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Usp9yF8VPU6 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Usp9yF8VPU6 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms