Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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Pdzd2E9Q1M1 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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