Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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Rabgef1Q9JM13 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rabgef1Q9JM13 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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