Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Col5a3Q9JLI2 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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