Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RpainQ9CWY9 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RpainQ9CWY9 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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