Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PtprnQ60673 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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