Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ulk3Q3U3Q1 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms