Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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ptchd1Q14B62 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ptchd1Q14B62 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms