Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sh3bp1P55194 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms