Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
VdrP48281 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
VdrP48281 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
VdrP48281 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175 ms