Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Pde6aP27664 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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