Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Nedd9O35177 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Nedd9O35177 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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