Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ArxO35085 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ArxO35085 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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ArxO35085 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ArxO35085 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ArxO35085 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms