Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Spocd1B1ASB6 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Spocd1B1ASB6 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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