Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms