Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Speer3W4VSP1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms