Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3550W4VSN7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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