Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm17190V9GX38 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm17190V9GX38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm17190V9GX38 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm17190V9GX38 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms