Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hdac6Q9Z2V5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac6Q9Z2V5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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