Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Knop1Q9Z2Q2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Knop1Q9Z2Q2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms