Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mbd3Q9Z2D8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms