Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ilf3Q9Z1X4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms